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材料學(xué)院符汪洋課題組合作在微小核糖核酸檢測(cè)領(lǐng)域取得進(jìn)展

清華新聞網(wǎng)10月14日電 2024年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)授予了兩位科學(xué)家,以表彰他們發(fā)現(xiàn)了微小核糖核酸(microRNA或miRNA)及其在轉(zhuǎn)錄后基因調(diào)控中的關(guān)鍵作用。miRNA被廣泛認(rèn)為是最具潛力的腫瘤標(biāo)志物之一。然而,作為一類長(zhǎng)度僅為18至25個(gè)核苷酸的小RNA分子,miRNA在血液中的濃度極低,現(xiàn)有檢測(cè)手段通常成本高昂、操作繁瑣且檢測(cè)時(shí)間較長(zhǎng)。因此,開發(fā)快速靈敏的現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)技術(shù)成為當(dāng)前研究的熱點(diǎn)。

近日,清華大學(xué)材料學(xué)院與首都醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院合作,取得了miRNA檢測(cè)技術(shù)的重要進(jìn)展,成功建立了一種超靈敏的miRNA快速檢測(cè)平臺(tái)。該平臺(tái)將雙鏈特異性核酸酶(DSN)與潔凈石墨烯原子層晶體管技術(shù)相結(jié)合,在實(shí)驗(yàn)室中實(shí)現(xiàn)了低至25aM濃度的miRNA檢測(cè)。同時(shí),該技術(shù)能夠直接檢測(cè)癌癥患者臨床血漿樣本中的miR-21致癌基因,無(wú)需提取總RNA或進(jìn)行預(yù)擴(kuò)增,大幅簡(jiǎn)化了檢測(cè)流程,為miRNA的快速靈敏現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)提供了新途徑。

圖1.DSN輔助的原子層晶體管用于快速靈敏現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)miRNA原理示意圖

圖1展示了原子層晶體管結(jié)合DSN酶的顯著優(yōu)勢(shì)。DSN酶的引入突破了基于堿基互補(bǔ)配對(duì)的傳統(tǒng)晶體管核酸傳感器設(shè)計(jì)。DSN酶具有特異性裂解DNA/RNA雙鏈中的DNA特性,同時(shí)不影響單鏈DNA和RNA,從而大幅放大了晶體管的檢測(cè)信號(hào),提升了傳感器的靈敏度和特異性。作為單原子層材料的典型代表,石墨烯的所有原子都暴露在外,使得其原子層晶體管在環(huán)境變化中展現(xiàn)出極高的靈敏度,并且能夠與現(xiàn)有的半導(dǎo)體技術(shù)無(wú)縫對(duì)接,重新定義生物化學(xué)傳感分析的標(biāo)準(zhǔn)。

為了驗(yàn)證所制備晶體管傳感器的臨床應(yīng)用性能,如圖2a所示,該研究對(duì)肝細(xì)胞癌(HCC)和子宮內(nèi)膜癌(EC)患者的臨床血漿樣本進(jìn)行了測(cè)試(在PCR檢測(cè)中,樣本中miR-21的平均相對(duì)表達(dá)水平分別為5.5和3.0)。作為對(duì)照,健康人樣本的miR-21的平均相對(duì)表達(dá)水平為1.1。在無(wú)需前期標(biāo)記或預(yù)擴(kuò)增的條件下,傳感器成功獲得了清晰的偏移信號(hào)(圖2b)。這些初步結(jié)果表明,DSN輔助的原子層晶體管能夠區(qū)分miR-21在癌癥患者中高于健康人群的表達(dá)水平(圖2c),驗(yàn)證了其在未預(yù)處理的臨床樣品中的檢測(cè)可行性。

圖2.DSN輔助的原子層晶體管用于臨床樣品中miR-21檢測(cè)。a.臨床血漿樣本的快速檢測(cè)流程圖;b.15個(gè)臨床樣本的信號(hào)偏移量。其中1-5為健康人群樣本,6-10為HCC患者樣本,11-15為EC患者樣本。每個(gè)測(cè)試重復(fù)3次并取平均;c.晶體管傳感器與qRT-PCR檢測(cè)臨床血漿樣本中miR-21表達(dá)水平的對(duì)比圖。顯著性標(biāo)記:*p< 0.01, **p< 0.005

相關(guān)研究成果以“雙鏈特異性核酸酶輔助的石墨烯場(chǎng)效應(yīng)晶體管生物傳感器:一種無(wú)需預(yù)擴(kuò)增的癌癥相關(guān)miRNA檢測(cè)新平臺(tái)”( Duplex-specific-nuclease-assisted graphene field-effect transistor biosensor: a novel platform for preamplification-free detection of cancer related miRNA”)為題,于9月26日在線發(fā)表于《碳》(Carbon)。

清華大學(xué)材料學(xué)院博士后王乾龍為論文第一作者,清華大學(xué)材料學(xué)院副教授符汪洋和首都醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院教授張曉艷為論文通訊作者。清華大學(xué)材料學(xué)院教授張政軍、副研究員凌云漢和副研究員王煒鵬等為研究作出重要貢獻(xiàn)。研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金等的支持。

論文鏈接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0008622324008893

供稿:材料學(xué)院

編輯:李華山

審核:郭玲

2024年10月14日 14:48:06

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