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生物醫(yī)學(xué)交叉研究院劉臻課題組開發(fā)出非天然苯胺合成酶

清華新聞網(wǎng)4月9日電 苯胺類化合物作為關(guān)鍵結(jié)構(gòu)單元,,普遍存在于藥物分子及其他活性物質(zhì)中,,同時是多種工業(yè)材料制備的核心中間體,。透明度市場研究(Transparency Market Research發(fā)布的《2021-2031年全球苯胺衍生物市場預(yù)測報告》顯示,,到2031年,,全球苯胺類衍生物的市場價值將達(dá)到110億美元。因此,,開發(fā)芳胺骨架的高效合成方法在藥物開發(fā)和材料科學(xué)等領(lǐng)域至關(guān)重要,。傳統(tǒng)的苯胺類化合物的工業(yè)合成工藝主要以苯或其衍生物出發(fā),通過苯環(huán)硝基化反應(yīng)以及隨后的硝基苯催化加氫獲得苯胺,。在醫(yī)藥中間體合成領(lǐng)域,,過渡金屬催化的C–N鍵偶聯(lián)反應(yīng)同樣被廣泛應(yīng)用,這類方法的發(fā)展對于藥物分子的構(gòu)建具有關(guān)鍵意義,。盡管這些經(jīng)典方法目前仍無可替代,,科研工作者持續(xù)致力于探索更加綠色溫和、可持續(xù)的合成體系,,從而最終避免使用高溫高壓的反應(yīng)條件,,或者高成本且具有生理毒性的過渡金屬催化劑。本研究聚焦生物酶催化體系的開發(fā),,通過定向進(jìn)化初步驗證了該策略合成苯胺類化合物的可行性,。值得注意的是,,相較于自然界中存在的基于P450體系的苯胺合成酶,這一生物催化體系展現(xiàn)出截然不同的催化機(jī)制,,為酶催化在苯胺合成領(lǐng)域的應(yīng)用提供了新的突破方向,。

4月7日,清華大學(xué)生物醫(yī)學(xué)交叉研究院劉臻課題組在《德國應(yīng)用化學(xué)》(Angewandte Chemie International Edition)發(fā)表了題為“氧化胺化合成苯胺的酶促平臺”(An Enzymatic Platform for Aniline Synthesis through Oxidative Amination)的研究論文,。通過改造該實驗室開發(fā)的黃素(FMN)依賴酶PtOYE(源自Parageobacillus thermantarcticus),,這一催化體系可以有效地將胺類化合物和環(huán)己酮衍生物組合,通過氧化胺化的機(jī)制制備多種二級和三級苯胺,。針對結(jié)構(gòu)不同的胺類底物,,研究人員分別通過兩條定向進(jìn)化路徑獲得了各自的優(yōu)勢突變體OYE_G3和OYE_M3,提高了酶催化的效率并抑制了環(huán)己酮直接脫氫生成苯酚的副反應(yīng),。通過多組動力學(xué)實驗,,研究人員系統(tǒng)研究了這類苯胺合成酶的催化機(jī)制。實驗表明,,優(yōu)勢突變體不僅提高了亞胺中間體芳構(gòu)化的催化效率,,且降低了環(huán)己酮直接脫氫生成苯酚的活性,形成了有利于目標(biāo)反應(yīng)的協(xié)同效應(yīng),。

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圖1.苯胺類化合物的生物合成新策略

研究初期,,研究人員首先對野生型黃素酶及其突變體的亞胺脫氫芳構(gòu)化活性進(jìn)行了系統(tǒng)性篩選。實驗數(shù)據(jù)顯示,,課題組現(xiàn)有酶庫中的OYE_G0突變體對于目標(biāo)反應(yīng)具有顯著的初始活性,,能夠以最高的轉(zhuǎn)化率(38%)催化生成目標(biāo)產(chǎn)物3aa且目標(biāo)產(chǎn)物與副產(chǎn)物4a的比例最優(yōu),體現(xiàn)了這類脫氫酶具有被進(jìn)一步優(yōu)化的潛力,。

基于這一發(fā)現(xiàn),,研究人員隨后利用OYE_G0作為起始模版,分別針對二級苯胺和三級苯胺的合成過程進(jìn)行了多輪蛋白質(zhì)工程化改造與篩選,。通過多個活性位點(diǎn)的定點(diǎn)飽和突變以及隨機(jī)突變,,研究人員最終分別獲得催化合成二級苯胺的突變體OYE_G3以及催化合成三級苯胺的優(yōu)勢突變體OYE_M3。

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圖2.針對二級與三級苯胺分別開展的蛋白質(zhì)工程化改造

在確定了最優(yōu)酶突變體和最適反應(yīng)條件之后,,研究人員系統(tǒng)地研究了這些苯胺合成酶的底物適用范圍,。結(jié)果表明,這種生物催化方法展示出了良好的底物兼容性和官能團(tuán)耐受性,,可以將不同取代的芐胺,、含雜環(huán)的伯胺以及部分烷基胺轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的二級苯胺;也可成功地將部分仲胺轉(zhuǎn)化為三級苯胺,。此外,,不同取代模式的環(huán)己酮也能參與反應(yīng)。在此基礎(chǔ)上,,研究人員選取多個底物進(jìn)行了制備規(guī)模的酶促反應(yīng),,成功合成出如3ad,、3ao等多種苯胺衍生物,,進(jìn)一步驗證了該方法的應(yīng)用潛力,。

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圖3.底物適用性拓展與部分放大試驗

為了深入了解這一酶促反應(yīng)的機(jī)理,研究人員對生物催化脫氫偶聯(lián)反應(yīng)進(jìn)行了一系列動力學(xué)研究,。首先,,研究人員使用二級苯胺合成酶進(jìn)化譜系中的各個變體針對3aa的酶催化合成進(jìn)行了時間進(jìn)程實驗,并通過Michaelis-Menten曲線分析酶的動力學(xué)參數(shù),。實驗結(jié)果表明定向進(jìn)化引入的突變有效地提高了苯胺合成酶OYE_G3的kcat,。隨后,研究人員用類似的方法對三級苯胺3ca的合成反應(yīng)進(jìn)行了時間進(jìn)程研究,。與二級苯胺合成體系不同的是,,三級苯胺合成反應(yīng)的前期會發(fā)生可逆的aza-Michael加成過程形成中間體6b,因此反應(yīng)會顯示出明顯的誘導(dǎo)期(induction period),。為了明確探究酶活性是否從環(huán)己酮脫氫轉(zhuǎn)移到亞胺脫氫,,研究人員比較了最初變體(OYE_G0)與定向進(jìn)化譜系的兩個最終變體(OYE_G3和OYE_M3)生成苯酚的活性變化(圖4e和4f)。實驗結(jié)果表明,,進(jìn)化后的變體對于苯酚生成過程的催化能力顯著下降,。

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圖4.苯胺合成酶系統(tǒng)的動力學(xué)研究

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圖5.酶催化苯胺合成反應(yīng)的推測過程

基于黃素依賴酶的獨(dú)特脫氫催化機(jī)制,研究人員開發(fā)了非天然的苯胺合成酶系統(tǒng),,可以有效地制備二級與三級苯胺衍生物,。這種酶催化系統(tǒng)可以通過后續(xù)的進(jìn)化進(jìn)一步提高催化效率,并通過計算與實驗結(jié)合的方式完善機(jī)制研究,??傮w而言,這項工作為苯胺化合物的合成提供了高效,、環(huán)境友好的生物合成策略,,在生物催化和藥物開發(fā)等領(lǐng)域具有重要的應(yīng)用前景。

清華大學(xué)生物醫(yī)學(xué)交叉研究院研究員劉臻為論文的通訊作者,,劉臻實驗室聯(lián)合培養(yǎng)博士生趙翔為論文的第一作者,。研究得到科技部、清華大學(xué)生物醫(yī)學(xué)交叉研究院以及北京生命科學(xué)研究所的支持,。

論文鏈接:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202505252

供稿:生物醫(yī)學(xué)交叉研究院

編輯:李華山

審核:郭玲

2025年04月09日 15:28:11

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