清華大學(xué)舉辦PHENIX應(yīng)用國際研討會
清華新聞網(wǎng)5月17日電 由清華大學(xué)結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心主辦的為期兩天的蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)精修軟件PHENIX應(yīng)用國際研討會于5月10日結(jié)束。

受邀進行報告的外籍教授。
本次會議邀請了美國勞倫斯伯克利國家實驗室的Pavel Afonine博士、Paul Adams博士、Nigel Moriarty博士、美國洛斯阿拉莫斯國家實驗室的Tom Terwilliger博士以及英國劍橋大學(xué)的Randy Read 教授做主題報告,會議還邀請了清華大學(xué)副校長、結(jié)構(gòu)生物學(xué)家施一公教授致辭。

施一公致辭。
5月9日上午研討會開幕,施一公為開幕式致辭,他表示本次會議對促進蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的深入研究和軟件實踐應(yīng)用有著重要意義。
五位外籍教授就研討主題分別做了報告。PHENIX是一個用X-射線晶體學(xué)解析生物大分子三維結(jié)構(gòu)的軟件,五位教授圍繞PHENIX軟件的設(shè)計特點、實驗過程中的建模問題、數(shù)據(jù)分析、新方法研究等內(nèi)容展開探討。Paul Adams博士指出目前分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫中存在大量不理想或是不準確的結(jié)構(gòu)解析,還進一步提出在解析過程中如何避免一些隨機性、系統(tǒng)性錯誤等問題。Tom Terwilliger博士深入講解了如何設(shè)計SAD(single wavelength anomalous diffraction)以及如何進行結(jié)果分析。他還強調(diào)了在分析圖表時需要注意的問題,并分享了如何建立模型。Randy Read教授介紹了一種解決晶體學(xué)中相位問題的新方法,即分子置換法。該方法可以有效的對未知結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)進行解析。Nigel Moriarty博士圍繞在結(jié)構(gòu)精修中如何對新配位體提出合理的立體化學(xué)限制等問題展開討論。Pavel Afonine博士介紹了生物大分子的單晶結(jié)構(gòu)解析現(xiàn)狀和低溫冷凍電鏡蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的解析與精修。

教授們正與學(xué)生交流。
10日,教授與學(xué)生密切交流,教授手把手的講解如何使用PHENIX軟件,并積極主動的到學(xué)生中間進行指導(dǎo)和交流。
供稿:結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心 編輯:常 松