【抗疫期間的清華科研】在家做科研:清華版疫情地圖誕生記
清華新聞網(wǎng)2月28日電(通訊員 楊美娟 丁玨 盛裕杰)新冠肺炎疫情的爆發(fā)牽動(dòng)著所有人的心,全國人民團(tuán)結(jié)一致共同抗擊疫情。在這一特殊時(shí)期,清華大學(xué)各院系課題組發(fā)揮專業(yè)所長,師生同心、科研戰(zhàn)“疫”,彰顯了清華人“服膺守善”的初心和“服務(wù)人民”的使命。
“最初,沒有人在意這場(chǎng)災(zāi)難,直到這場(chǎng)災(zāi)難和每個(gè)人息息相關(guān),2020年才剛剛開始,中國疫情防控,我們共同努力!”
伴隨著簡(jiǎn)短有力的開篇詞,2月6日晚,疫情大數(shù)據(jù)可視化分析平臺(tái)(COVID-19 Visualization Dashboard )正式上線。而這一廣受清華師生好評(píng)、一度占領(lǐng)朋友圈的“清華疫情地圖”,正是由計(jì)算機(jī)系教授李國良帶領(lǐng)的數(shù)據(jù)庫實(shí)驗(yàn)室課題組自主開發(fā)而成。通過該平臺(tái),清華師生們不僅能夠直接在手機(jī)上查詢周邊疫情信息,還可以科學(xué)把握疫情發(fā)展趨勢(shì),從而更好地為自己和家人開展科學(xué)防護(hù)。

疫情可視化平臺(tái)可實(shí)時(shí)清晰展示縣市、省份、世界三級(jí)疫情分布
據(jù)了解,疫情可視化平臺(tái)涵蓋“疫情小區(qū)查詢”“可視化分析”“疫情分析報(bào)告”等功能,通過“疫情熱力圖”“病患類型日歷圖”“疫情歷史回放”等可視化數(shù)據(jù),清華師生能夠迅速“看”懂?dāng)?shù)據(jù),及時(shí)掌握社區(qū)疫情動(dòng)向,了解返工潮對(duì)所在城市疫情的影響,科學(xué)判斷世界疫情分布趨勢(shì)。
在嚴(yán)峻的疫情防控形勢(shì)下,與疫情相關(guān)的信息自然成為了公眾關(guān)注的焦點(diǎn)。疫情可視化平臺(tái)一經(jīng)上線就受到了校內(nèi)外師生的一致歡迎,訪問量突破十萬人次,部分師生和社會(huì)群眾還向課題組發(fā)送郵件表示謝意。同時(shí),卡內(nèi)基梅隆大學(xué)、香港大學(xué)、武漢大學(xué)和吉林大學(xué)等國內(nèi)外高校的新冠病毒研究團(tuán)隊(duì)都希望能和數(shù)據(jù)庫課題組展開后續(xù)合作,基于平臺(tái)數(shù)據(jù)進(jìn)行相關(guān)科研課題的研究。
那么,這樣一個(gè)依靠技術(shù)征服清華師生的硬核平臺(tái)是如何誕生的呢?讓我們一起來走近項(xiàng)目組,探訪“清華疫情地圖”背后的故事。
從靈感到實(shí)現(xiàn):導(dǎo)師的激勵(lì)猶如定海神針
除夕前夜,本是闔家團(tuán)聚、一起吃年夜飯的日子。因?yàn)樾鹿诜窝滓咔榈募彼俾樱珖嗣穸纪V沽俗哂H訪友,一邊在家自我防控,一邊刷著手機(jī)、了解疫情動(dòng)態(tài)。計(jì)算機(jī)系2018級(jí)碩士生駱昱宇也時(shí)刻關(guān)注著疫情的發(fā)展情況。他發(fā)現(xiàn),國家衛(wèi)健委官網(wǎng)上發(fā)布的只有各個(gè)地區(qū)的確診人數(shù),沒有感染者所在的位置,人們很難直觀地掌握周邊疫情的蔓延情況。考慮到自己擁有較為豐富的數(shù)據(jù)可視化專業(yè)知識(shí),駱昱宇便思考著能否學(xué)以致用,借助熱力地圖的理念,通過地圖的形式直觀顯示出某一地區(qū)的確診人數(shù)及其變化,方便老師同學(xué)們及時(shí)把握疫情動(dòng)向。

最初設(shè)想的熱力圖由課題組成員、計(jì)算機(jī)系2017級(jí)博士生趙天宇開發(fā)完成,可同時(shí)展示疫情分布及其嚴(yán)重程度
萬事開頭難。在想法剛要付諸實(shí)踐之際,駱昱宇便遭遇到了現(xiàn)實(shí)的困難。他發(fā)現(xiàn),衛(wèi)健委官網(wǎng)上的疫情數(shù)據(jù)不夠規(guī)整,此外,精準(zhǔn)獲取疫情數(shù)據(jù)、并對(duì)各地區(qū)數(shù)據(jù)進(jìn)行融合的難度也不小。面臨多重困難,駱昱宇心中不免打起了退堂鼓。正要放棄之時(shí),導(dǎo)師李國良教授聯(lián)系了駱昱宇,希望他利用專業(yè)所學(xué)開發(fā)疫情可視化平臺(tái),為人們展現(xiàn)更準(zhǔn)確、更易用的疫情信息。駱昱宇將自己的想法和遇到的困難告訴了李國良老師,李老師鼓勵(lì)他:“做任何事(不管是科研還是工作),剛開始都會(huì)遇到困難,只有堅(jiān)持下來才會(huì)柳暗花明。現(xiàn)在全社會(huì)各個(gè)行業(yè)都在為疫情防控作貢獻(xiàn),我們數(shù)據(jù)庫實(shí)驗(yàn)室既然有數(shù)據(jù)分析的特長,也理當(dāng)做一些自己力所能及的事情。”正是李國良老師的這番話讓駱昱宇受到了鼓舞,堅(jiān)定了“程序報(bào)國”的信念,并且下定決心克服困難,將想法變?yōu)楝F(xiàn)實(shí)。
師門同心戰(zhàn)“疫”,攻克技術(shù)難題
雖然駱昱宇等課題組同學(xué)懷抱著“程序報(bào)國”的信念,但現(xiàn)實(shí)的困難仍然橫亙?cè)谘矍埃渲凶畲蟮睦щy就是疫情數(shù)據(jù)的獲取。由于缺乏統(tǒng)一的高細(xì)膩度的數(shù)據(jù)源,課題組同學(xué)必須通過多個(gè)數(shù)據(jù)源的比對(duì)來獲得準(zhǔn)確數(shù)據(jù)。為此,李國良老師與幾位課題組同學(xué)成立了數(shù)據(jù)共享群,與其他研究團(tuán)隊(duì)分享數(shù)據(jù)。解決了數(shù)據(jù)來源問題后,在李國良老師和卡塔爾計(jì)算研究所湯南博士的指導(dǎo)下,課題組對(duì)疫情數(shù)據(jù)進(jìn)行建模分析和可視化。很快,在課題組師生爭(zhēng)分奪秒的不懈努力下,疫情可視化平臺(tái)在兩天內(nèi)就初步上線了,當(dāng)晚便有近一萬人次的訪問量。

借助疫情小區(qū)查詢模塊,師生可及時(shí)掌握社區(qū)疫情動(dòng)向
然而,平臺(tái)的上線意味著更多新的困難。計(jì)算機(jī)系2017級(jí)博士生余翔負(fù)責(zé)開發(fā)疫情預(yù)測(cè)模塊,通過該模塊,清華師生可快速了解未來三天內(nèi)各地區(qū)的確診病例、治愈病例以及死亡病例的變化趨勢(shì)。但在2月12日,由于病例判斷標(biāo)準(zhǔn)的改變,湖北省一天之內(nèi)新增了1.5萬確診人數(shù),課題組不得不對(duì)原先的模型進(jìn)行了調(diào)整。而類似的突發(fā)情況在平臺(tái)的升級(jí)維護(hù)過程中還出現(xiàn)過許多次。

隨著新冠肺炎疫情成為國際關(guān)注的衛(wèi)生事件,平臺(tái)進(jìn)一步推出英文版本
為了更好地維護(hù)平臺(tái),課題組每位同學(xué)都會(huì)獨(dú)立負(fù)責(zé)一個(gè)版塊,李國良老師負(fù)責(zé)統(tǒng)籌各版塊進(jìn)展情況。“我們課題組有一個(gè)群,項(xiàng)目剛開始的時(shí)候,每天都要討論第二天的工作內(nèi)容。因?yàn)橐咔橐惶煲粋€(gè)情況,即使李老師有時(shí)候工作到半夜,還是會(huì)在群里詢問進(jìn)展情況并提出指導(dǎo)意見。”余翔說道。趙天宇也表示:“每當(dāng)我們?cè)谌豪飬R報(bào)進(jìn)展時(shí),李老師都會(huì)親自測(cè)試新功能,并告訴我們問題出在哪。正是李老師對(duì)這個(gè)項(xiàng)目的重視給了我們做下去的動(dòng)力。”李國良老師和課題組師兄們的嚴(yán)謹(jǐn)認(rèn)真和相互扶持同樣感動(dòng)著剛接觸科研沒多久的2019級(jí)碩士生張力兮和2017級(jí)本科生李文博:“我們課題組人數(shù)不多,每個(gè)人的工作量都非常大,特別是駱師兄,經(jīng)常半夜維護(hù)和更新網(wǎng)站,凌晨突然討論起來也不是少數(shù)。”
疫情地圖的背后:程序員的報(bào)國心
自從上線以來,疫情可視化平臺(tái)獲得了校內(nèi)外師生的廣泛關(guān)注,迄今已有十余萬人次的訪問量。課題組同學(xué)在談到一路走來的心路歷程時(shí),提及最多的一句話便是:“雖然不能像醫(yī)務(wù)工作者那樣奔赴前線,但我們希望能各出所學(xué),各盡所知,程序報(bào)國。”

病患類型比例日歷顯示肺炎疫情治愈比例不斷提高
李國良老師也多次在課堂、組會(huì)上告誡課題組同學(xué)們:“這個(gè)項(xiàng)目快一個(gè)月了,大家都收獲了很多,確實(shí)是通過自己學(xué)到的技能來回饋社會(huì),非常有意義。回頭看,做這件事是值得的,如果再選一次我們還會(huì)做出同樣的選擇。”李國良老師還啟發(fā)同學(xué)們通過這場(chǎng)疫情思考自己作為科研工作者所應(yīng)肩負(fù)的使命:“2003年的‘非典’以及17年后的這場(chǎng)疫情都是一個(gè)提醒,希望我們能夠重視起來,去思考如何通過新技術(shù)來防控自然災(zāi)害,服務(wù)大眾,技術(shù)安邦。”
導(dǎo)師的言傳身教不僅安頓了同學(xué)們由于疫情而產(chǎn)生的惶惶之心,也促使課題組同學(xué)們樹立起以程序報(bào)效祖國,以技術(shù)服務(wù)大眾的蹈厲之志。正如張力兮所說:“我們整個(gè)課題組是有溫度的,一起工作的內(nèi)容也是有溫度的。這些日子和老師、師兄們一起工作,讓我更加堅(jiān)信寒冬終會(huì)過去,溫暖的春天即將來到。”

數(shù)據(jù)庫實(shí)驗(yàn)室課題組師生合影(拍攝于2019年1月)
同心戰(zhàn)“疫”,共克時(shí)艱,自強(qiáng)的清華人永遠(yuǎn)保持奮進(jìn)的姿態(tài),期待著疫情消散后和同學(xué)們?cè)倬矍迦A園!
供稿:校研會(huì)
編輯:李晨暉
審核:呂 婷