清華新聞網(wǎng)6月15日電 新冠肺炎(COVID-19)目前在全世界多個(gè)國家暴發(fā)流行,,新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)核酸檢測目前是實(shí)驗(yàn)室病原檢測的金標(biāo)準(zhǔn),。為保護(hù)實(shí)驗(yàn)室檢測人員不受感染,大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室使用滅活標(biāo)本進(jìn)行核酸檢測,。西安市疾病預(yù)防控制中心馬超鋒團(tuán)隊(duì)和清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院郭永團(tuán)隊(duì)合作,,利用絕對定量的微滴數(shù)字PCR(ddPCR)技術(shù)檢測新冠病毒N基因和ORF 1ab基因,比較了TRIzol試劑,、不同溫度的熱滅活方法對臨床樣本中新型冠狀病毒基因拷貝數(shù)的影響,,為實(shí)驗(yàn)室選擇適宜滅活方法且提高檢出率提供了科學(xué)依據(jù)。該研究結(jié)果于5月28日在《臨床微生物學(xué)期刊》(Journal of Clinical Microbiology)發(fā)表(doi:10.1128/JCM.00958-20),。
該研究收集了61份新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)核酸檢測陽性的鼻咽拭子標(biāo)本,采用了以下幾種滅活方法:1,、TRIzol試劑在室溫下滅活10分鐘,;2、在56℃水浴中加熱30分鐘,;3,、高溫處理,包括121℃高壓20分鐘,、100℃沸水浴煮沸20分鐘,、80℃水浴加熱20分鐘。該研究發(fā)現(xiàn),,與原始樣品中的RNA量相比,,TRIzol處理破壞了47.54%的N基因和39.85%的ORF 1ab基因;56℃30分鐘加熱處理后,,N基因和ORF 1ab拷貝數(shù)分別減少48.55%和56.40%,;在80℃加熱20分鐘后,病毒RNA拷貝數(shù)下降了50-66%;121℃高壓滅菌或100℃煮沸20分鐘破壞了絕大部分病毒RNA,,幾乎未檢測到病毒RNA,。

圖1 TRIzol室溫10分鐘處理對生物標(biāo)本中新冠病毒基因拷貝數(shù)的影響

圖2 56℃加熱30分鐘處理對生物標(biāo)本中新冠病毒基因拷貝數(shù)的影響

圖3 80℃、100℃及121℃加熱20分鐘處理對生物標(biāo)本中新冠病毒基因拷貝數(shù)的影響
該研究結(jié)果表明,,滅活降低了可檢測到的病毒RNA數(shù)量,,尤其對于弱陽性標(biāo)本,可能導(dǎo)致假陰性結(jié)果,。相較于熱滅活,,TRIzol處理對病毒核酸拷貝數(shù)影響更小,因此推薦使用TRIzol對臨床樣本進(jìn)行滅活處理,。
吳瑞,、陳海龍、邢遠(yuǎn)博士為該研究的共同第一作者,,馬超鋒和郭永為該研究的共同通訊作者,。該項(xiàng)目得到西安市新型冠狀病毒肺炎疫情應(yīng)急防治專項(xiàng)項(xiàng)目、清華大學(xué)疫情防控科技攻關(guān)應(yīng)急課題,、北京市科委新冠肺炎應(yīng)急項(xiàng)目,、新羿生物等單位或項(xiàng)目的支持。
供稿:醫(yī)學(xué)院
編輯:李華山
審核:程曦