CRISPR/Cas9系統(tǒng)是細(xì)菌和古細(xì)菌在長(zhǎng)期演化過程中形成的一種適應(yīng)性免疫防御,可用來對(duì)抗入侵的病毒及外源DNA,。通過人工設(shè)計(jì)包含Cas9結(jié)合靶點(diǎn)序列的指導(dǎo)RNA(guide RNA),,Cas9可用于對(duì)基因組中特異位點(diǎn)的切割。不僅如此,,失去核酸酶活性的dCas9也可用于基因表達(dá)調(diào)控,,以及DNA位點(diǎn)的標(biāo)記。因此,,通過使用合成基因線路,,準(zhǔn)確和定制化地調(diào)節(jié)dCas9功能,從而響應(yīng)多種分子信號(hào)將會(huì)擴(kuò)展CRISPR/Cas技術(shù)的相關(guān)應(yīng)用,。然而,,由于現(xiàn)存病毒遞送載體容量大小的限制,使用基于CRISPR/Cas系統(tǒng)用于疾病治療的基因線路仍然有很大的挑戰(zhàn),。
但近期,,清華信息科學(xué)與技術(shù)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室(籌)謝震課題組在減少基于CRISPR/Cas的基因線路大小這一方面取得突破性進(jìn)展。該課題組于2016年10月3日在《自然˙通訊》發(fā)表了題為“Integration and exchange of split dCas9 domains for transcriptional controls in mammalian cells”的研究論文,,首次報(bào)道了在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,,通過合理拆分Cas9/dCas9蛋白,利用多輸入合成基因線路感知不同分子信號(hào),,如細(xì)胞特異的microRNA,,實(shí)現(xiàn)了在不同類型細(xì)胞中對(duì)Cas9/dCas9活性的精確調(diào)控,為精確控制CRISPR/Cas9基因編輯工具提供了新的策略。
在這項(xiàng)研究中,,課題組首先驗(yàn)證了利用內(nèi)含肽拆分Cas9/dCas9的可行性,,并實(shí)現(xiàn)了基于拆分dCas9的三輸入邏輯“與門”基因線路,通過拆分dCas9的結(jié)構(gòu)域并進(jìn)行互換實(shí)現(xiàn)了控制單個(gè)或兩個(gè)不同基因表達(dá)的基因開關(guān),??偟膩碚f,,該研究提供了一種有價(jià)值的拆分dCas9的工具,可實(shí)現(xiàn)復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄控制,,在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域有著潛在的應(yīng)用價(jià)值,。
謝震課題組開發(fā)的結(jié)構(gòu)域可控交換策略特異性控制dCas9功能,是該課題組繼2015年在《自然˙化學(xué)生物學(xué)》報(bào)道利用TALE轉(zhuǎn)錄抑制子模塊化拼裝合成基因線路之后,,對(duì)合成生物學(xué)領(lǐng)域的又一重要貢獻(xiàn),。
謝震研究員是該論文的通訊作者,清華大學(xué)自動(dòng)化系博士生馬大程是該文的第一作者,,自動(dòng)化系碩士生彭曙光為該文的共同第一作者,。該研究得到了科技部973計(jì)劃、清華信息科學(xué)與技術(shù)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的資助,。