美國太平洋時間2017年10月16日,與“人類基因組計劃”相媲美的“人類細胞圖譜計劃” 首批擬資助的38個項目正式公布。清華大學(xué)教授張學(xué)工負責的項目作為其中唯一一個由中國科學(xué)家承擔的項目,從全球范圍內(nèi)征集的近500個項目中脫穎而出。
“人類細胞圖譜計劃”是一項大型國際合作項目,致力于建立一個健康人體包含的所有細胞參考圖譜,包括各種細胞類型的基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀基因組特性以及它們的數(shù)目、位置、相互關(guān)聯(lián)等。該計劃是是由Facebook創(chuàng)始人馬克·扎克伯格和妻子普莉希拉·陳成立的CZI(Chan Zuckerberg Initiative)基金會發(fā)起并資助的,通過全世界范圍內(nèi)優(yōu)秀的生物學(xué)家、技術(shù)專家、病理學(xué)家、醫(yī)學(xué)專家、計算機科學(xué)家、統(tǒng)計學(xué)家等共同討論提出的一個具有劃時代意義的大科學(xué)項目。
目前的項目是一年期的預(yù)研究,肩負著探索整個計劃如何開展的重任。這批項目的主要任務(wù)是建立完成整個圖譜所需各種技術(shù)和工具的基準參照。“現(xiàn)在是一個宏大的計劃的開始,是整個計劃中非常激動人心的時刻。”張學(xué)工說。
從十幾年前起,張學(xué)工及其團隊便開始把研究重點放在轉(zhuǎn)錄組分析的生物信息學(xué)方法和對各種轉(zhuǎn)錄組的分析上,在用RNA測序進行轉(zhuǎn)錄組分析方面發(fā)展了一系列生物信息學(xué)方法,并在國際同行中得到了很多有效應(yīng)用。
對人類各種類型的細胞進行單細胞測序研究是“人類細胞圖譜計劃”中的核心內(nèi)容,生物信息學(xué)分析在其中肩負著至關(guān)重要的作用。由于單細胞測序技術(shù)發(fā)展迅速,這一方面極大地促進了整個領(lǐng)域的發(fā)展,另一方面也導(dǎo)致目前一些分析方法缺乏系統(tǒng)深入的推敲。張學(xué)工在此次申請中提出,在“人類細胞圖譜計劃”中對差異分析、聚類等核心問題的生物信息學(xué)方法進行系統(tǒng)地研究,這是整個計劃中非常重要的基礎(chǔ)工作。
CZI基金會組織多位遺傳學(xué)家、基因組學(xué)家、分子生物學(xué)家、醫(yī)學(xué)家、細胞生物學(xué)家、生物化學(xué)家、系統(tǒng)生物學(xué)家和生理學(xué)家對近500份申請進行了評審,篩選了全球38個項目進行首批資助。作為中國目前唯一入選的團隊負責人,張學(xué)工表示,希望能夠不辜負大家的期望,在這個重大的國際合作研究計劃中作出應(yīng)有的貢獻,也希望通過這個預(yù)研究項目,將來能夠引導(dǎo)更多中國團隊加入“人類細胞圖譜計劃”的研究。