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李梢課題組發(fā)現(xiàn)胃癌極早期標志物:“英雄”莫問出處

2019.06.21

    素材提供

    自動化系

     

    文字采寫
    楊鵬成


    圖片設計

    趙存存

     

    編審
    盧小兵   程曦
    張歌明   張莉
     
    欄目統(tǒng)籌
    程曦

“大家總是拿中醫(yī)和西醫(yī)作比較,,我覺得不管中醫(yī)還是西醫(yī),,關鍵是能夠治病救人。”當清華大學自動化系教授,、清華信息科學與技術國家實驗室中醫(yī)藥交叉研究中心主任李梢被問及此類問題時,,他這樣提出自己的觀點,。“這就像我的課題組一樣,,雖然學生的專業(yè)背景不同,,但英雄不問出處,,大家齊心協(xié)力,以解決問題為首要目的,。”

今年5月,,李梢課題組又解決了一個難題——以課題組博士生張鵬為第一作者的論文《解析胃癌前病變和早期胃癌的單細胞轉錄組網絡》作為長文發(fā)表在國際著名學術期刊《細胞》的子刊《細胞報告》(Cell Reports)上。該研究通過胃炎和胃早癌患者單細胞測序,,首次成功捕捉胃癌發(fā)生的單細胞微弱信號及其網絡關聯(lián),,突破性地發(fā)現(xiàn)了胃癌極早期細胞標志物,在胃炎癌轉化單細胞機制和極早期診斷方面取得重大進展,。“這就相當于我們去抓恐怖分子,,等恐怖事件發(fā)生后才抓到就晚了,我們要事先找到與恐怖分子相關的人并一網打盡,,防止事態(tài)發(fā)生,。”李梢打了個生動的比方。

李梢1999年就提出了中醫(yī)藥和生物分子網絡相關的假說,。隨后,,他將傳統(tǒng)中醫(yī)診斷描述和統(tǒng)一醫(yī)學語言系統(tǒng)(UMLS)相結合,對中醫(yī)診斷進行標準化描述,?;诖耍⒘藦恼w上銜接“疾病表型”與患者“基因型”兩個生物網絡之間的計算模型,。通過對這一模型的深入探索,,李梢課題組以胃癌的中西醫(yī)防治為范例,從“表型-細胞-分子”多層次生物網絡的角度揭示了胃炎癌轉化的內在機制,,發(fā)現(xiàn)了胃癌極早期標志物和能夠抑制胃炎癌轉化的中藥成分,。

作為中醫(yī)藥學和生物信息學的交叉學科,李梢課題組的學生涵蓋了自動化,、計算機,、生物醫(yī)藥、中醫(yī)藥等不同的專業(yè)背景,。大家雖然專業(yè)不同,,但是都有著治病救人的共同愿景;雖然各有專攻,,但都會親自參與臨床觀察和采樣,、學習相關的醫(yī)學藥學知識。“別人覺得有困難的地方,,我們才要堅持做下去,,不然何談創(chuàng)新,?”在有關胃炎和胃癌的研究中,課題組需要對比觀察正常人,、胃炎和胃癌患者不同階段的胃部細胞,,當最初找不到正常人的胃部組織樣本時,課題組的博士生還主動提出做胃鏡,、用自己的樣本來做實驗,。這種追求卓越、勇于奉獻的精神正是課題組能夠解決一個又一個難題的法寶,。

出生在中醫(yī)藥世家的李梢從本科到博士都是主攻中醫(yī)藥專業(yè),,在接觸臨床知識與訓練的過程中,他逐漸認識到當前醫(yī)療手段的欠缺,、醫(yī)學對基礎科研的迫切需求以及中醫(yī)藥在現(xiàn)代的發(fā)展困境,。因此2001年博士畢業(yè)后,他來到清華大學自動化系做李衍達院士的博士后,,在李院士的支持下,,率先開展生物信息學與中醫(yī)藥現(xiàn)代化大跨度交叉學科研究。李稍選擇當時剛剛出現(xiàn)的生物信息學作為自己的主要方向,,是因為中醫(yī)“重視整體”的內在邏輯與生物信息學的基本原理是契合的,。中醫(yī)面臨的問題需要用生物信息學的方法解決,而自動化領域內信息論的發(fā)展又要與實際的問題相結合,。

中醫(yī)強調整體觀,,將一個整體拆成一個個零件是相對容易的,而將一個個零件重新組合成一個整體,,尤其是組合人體這么復雜的生物系統(tǒng),,則要困難得多。但中醫(yī)診斷和治療過程將人體作為一個“黑箱”看待,,對于黑箱的內部原理缺少證明的方法,,中醫(yī)藥理論也與近代生物學“從基因到性狀”的基本研究方法和理論存在隔閡。而生物信息學,、系統(tǒng)生物學等新方法的出現(xiàn),,則為中醫(yī)藥研究帶來了理解其整體性質的希望;中醫(yī)藥的整體特色,,又為前沿科技的發(fā)展和突破提供了豐富的資源,。通過學科交叉,李梢教授課題組還相繼開拓了網絡藥理學,、中醫(yī)藥人工智能等新方向,,不僅有助于推動中醫(yī)藥現(xiàn)代化,也為開發(fā)新的疾病診療方法提供了全新的研究思路,。

2014年11月4日,,美國《華爾街日報》用兩個版面刊發(fā)了題為“古老療法的新資料”的長篇報道,,突出介紹了李梢課題組在中醫(yī)藥網絡藥理學和系統(tǒng)生物學方向上的有關成果,即通過建立復雜生物系統(tǒng)的網絡分析方法,,發(fā)現(xiàn)慢性胃炎典型寒證,、熱證患者代謝與免疫分子網絡失衡的特征、相關生物標志物和舌苔差異菌群,,突破了中醫(yī)客觀化,、微觀化的難點,為中醫(yī)藥個體化診療提供了科學證據(jù),,為科學理解中醫(yī)藥特色內涵提供了一條新途徑。

正如李梢的博士生導師王永炎院士所言,,中醫(yī)現(xiàn)在處于“乍暖還寒”時候,,雖然國家大力鼓勵傳承和創(chuàng)新,但是中醫(yī)在科學上的瓶頸還沒有得到根本上的突破——如何解釋復雜的中醫(yī)藥,、復雜的生命系統(tǒng)等,,這些都還不清楚,中醫(yī)的傳承與創(chuàng)新仍需付出巨大的努力,。“中醫(yī)藥缺乏符合自身整體特色的科學研究方法,,這是一個發(fā)展困境。難題如何解決呢,?亟需找到新理論,、新方法。只有真正維護人類健康,,為醫(yī)療,、科技和社會發(fā)展作出貢獻,中醫(yī)藥才會更好地被大家認可和接受,,挑戰(zhàn)才能轉變成機遇,,中醫(yī)藥才會發(fā)展得越來越好。”在這條道路上,,李稍和他的團隊還將繼續(xù)創(chuàng)新求索,。